خانه ی آیت الله سید روح الله خاتمی یکی از جاذبه های مهم گردشگری در استان یزد می باشد. این خانه در سال 1382 در اختیار میراث فرهنگی قرار گرفت و در سال 1383 به عنوان موزه ی رجال ومفاخر در معرض دید عموم قرار گرفت. درب ورودی خانه در قسمت شمال شرقی آن واقع شده است. در قسمت غربی آن چهار اتاق قرار دارد. حیاط خانه در سمت جنوبی قرار گرفته است. در همان قسمت تالاری بزرگ نیز دیده می شود و حیاطی کوچک تر نیز در پشت تالار وجود دارد. مطبخ نیز در راهروی غربی خانه واقع شده است.
تزئینات خانه نیز شامل گچبری هایی در بخش شمالی خانه و طاق های قسمت غربی است و همچنین در های چوبی قدیمی زیبا .
